聚类分析 聚类分析

聚类分析

  • 类别:实用工具
  • 大小:3.04 MB
  • 更新:2024-02-04 20:58:06
  • 版本:
软件简介

聚类分析软件(1.2版)是一个简单实用的聚类数据分析软件。通过该软件,用户可以分析相应的实验数据。该软件提供了多种数据计算方法,包括计算杂合度、计算多态性、计算欧氏距离和执行聚类计算。你可以根据实验数据的类型来选择。该软件主要用于计算杂合度、多态信息含量、遗传距离和聚类分析,适用于血型、蛋白质多态性、品种聚类等。各种数据按Nei公式(1974)进行分析计算。计算完成后,系统自动判断当前所有矩阵包含的数据,并导出为Excel文件,方便用户保存和使用。有需要的朋友可以赶紧下载试试!

软件功能

定义矩阵:定义数据矩阵的大小,用“长宽”表示,X轴方向为变化量,Y轴为数据量;用罗杰公式计算遗传距离时只需根据需要输入分类号(位数),系统默认值为“1”。如果输入“5”“4”和“2”,则表示有5个品种,4行数据,2个基因位点。该系统支持多达255个品种和9999条数据。

输入数据:根据定义的矩阵创建一个空白矩阵;如果没有定义矩阵大小,则根据当前矩阵的大小创建一个空白矩阵。

读入数据:通过“保存矩阵”命令将保存在磁盘上的数据读入系统,系统会自动创建一个大小与之对应的矩阵,并读取所有数据。

附加数据:在当前矩阵的末尾继续添加一个保存的数据,主要用于计算遗传距离。

读入遗传距离:读入保存在磁盘上的遗传距离数据,可直接用于聚类计算。

数据归一化:当前矩阵中的数据按照“标准差标准化法”进行处理。注意:单击此命令后,处理后的数据将用于计算遗传距离和聚类。只有重新读取或查看原始数据后,才会恢复原始数据,然后根据原始数据计算遗传距离和聚类计算。

杂合度的计算:根据Nei's公式(1974)计算各品种的杂合度。

计算多态性:根据Nei的公式(1974)计算每个品种的多态性信息量。

欧氏距离的计算:将数据读入系统后,可以使用该命令根据罗杰公式计算品种间的遗传距离。注意:如果类别数(等位基因数)没有在定义矩阵中定义,系统默认为1。在这种情况下,计算的遗传距离与Mahalanobis公式计算的遗传距离相同。未注册用户最后三个品种的遗传距离不显示。

遗传距离的计算:将所有数据读入系统后,可以使用该命令根据Nei's公式(1983)计算品种间的遗传距离。未注册用户最后三个品种的遗传距离不显示。

聚类计算:在计算或读入遗传距离后,可以使用该命令根据P.H.A.Sneath等人(1973)的类平均聚类法(UPGMA法,也称为未加权算术平均配对聚类法)进行系统聚类。聚类结果显示,第一列的数字是序号,。。聚类时间。第二列d是距离系数;第3列和第4列breed1和breed2是参与聚类的两个品种,第5列Cluster是聚类后的新名称,第6列Content是两个品种的名称。未注册用户的最后3个聚类结果不会显示。

查看原始数据:将原始数据读入当前矩阵。并且标准化的数据被清除。

查看遗传距离:在当前矩阵中显示读取的遗传距离或计算的遗传距离。

查看聚类图:根据聚类后的结果自动绘制聚类图。

保存聚类图:将显示的聚类图作为图像文件保存到磁盘。未注册用户没有此功能!

保存矩阵:将当前矩阵保存到磁盘。如果当前矩阵是原始数据,则保存原始数据;如果是归一化数据,保存处理后的数据;如果是杂合性,杂合性保存;如果它是聚类res

数据导出:系统自动判断当前所有矩阵中包含的数据,并导出为Excel文件。未注册用户没有此功能!

安装方法

1.下载解压后的文件,找到JLFX.EXE,双击安装。

2.进入安装界面,点击下一步安装。

3.选择安装目录D:tools Desktop pc0359,用户也可以自行更改其他安装位置。

4.创建菜单文件夹聚类分析,可以帮助用户快速找到软件的位置。

5、创建桌面快捷方式,可以快速打开桌面上的软件,点击是。

6、安装预览,可以查看所有的安装信息。单击“上一步”进行修改。

7.安装正在进行,请稍候。

使用方法

1.安装完成后,点击桌面上的软件,打开如图所示的界面。

2.点击矩阵大小,可以控制数据矩阵,定义数据矩阵的大小,用“长宽”表示,X轴方向为变化量,Y轴为数据量;用罗杰公式计算遗传距离时只需根据需要输入分类号(位数),系统默认值为“1”。如果输入“5”“4”和“2”,则表示有5个品种,4行数据,2个基因位点。该系统支持多达255个品种和9999条数据。

3.输入数据,将您的分析数据文件导入软件进行分析,并根据定义的矩阵创建空白矩阵。如果未定义矩阵大小,则根据当前矩阵大小创建一个空白矩阵。

4.数据归一化,可以自动对数据进行排版,并按照标准差标准化方法对当前矩阵中的数据进行处理。注意:单击此命令后,处理后的数据将用于计算遗传距离和聚类。只有重新读取或查看原始数据后,才会恢复原始数据,然后根据原始数据计算遗传距离和聚类计算。

5.计算命令。可以点击不同的计算项进行数据分析,有计算杂合度、计算多态性、计算欧氏距离、聚类计算等功能。

6.数据查看和保存命令,查看原始数据,查看遗传距离,保存聚类图,保存矩阵和数据导出。

运行环境

1.硬件环境:

硬件名称最低配置推荐配置

1).CPU CPU 586奔腾P或以上或兼容芯片。

2).内存大于32M 64M。

3).硬盘可用空间大于1m和10m。

4).显示VGA真彩色超级VGA或液晶显示器。

2.软件环境:

操作系统:Windows95/98/Me/Nt/2000/Xp。

并且安装了Excel97及以上的办公软件,否则无法将数据导出到Excel文件。

3.推荐使用:Win2000或Xp操作系统Office2000。该软件已通过win98和win2000的测试。如果不能正常运行,请联系作者。

用户评论

浅笑√倾城

聚类分析真是太厉害了!以前做数据挖掘总是很头疼,现在有了聚类分析,就轻松多了。感觉像把一堆杂乱的数据给分类整理了一下,能更好理解数据的本质特征,非常有用!

    有14位网友表示赞同!

有阳光还感觉冷

刚开始接触聚类分析,有点懵逼

软件截图
推荐内容
更多
光遇织光季家具兑换方法一览

光遇织光季在近期正式更新上线,每个季节都有着许多全新内容和资讯可以让你来体验,不少刚体验的小伙伴想要知道

2026-02-02
绝区零千夏技能爆料一览

绝区零2.6版本将在本周正式更新上线,上周的前瞻直播官方给玩家们带来关于最新版本的卡池信息和相关活动内容,

2026-02-02
明日方舟终末地全干员喜欢礼物一览

明日方舟终末地一款画面相当不错近期非常火爆的大型二次元冒险游戏,这里有相当多好看的干员可以让你来抽取并

2026-02-02
绝区零2.6版本更新时间一览

绝区零2.6版本前瞻特别节目在上周末正式播出,官方给玩家们带来了许多关于最新版本的相关资讯和上线时间,不少

2026-02-02
蛋仔派对×小马宝莉联动定档2月17日 联动外观将登场

蛋仔派对近日宣布了跟“小马宝莉”的重磅联动!并且时间定档在了2月17日,此次联动将会上新很多外观,各种小马宝

2026-02-02
失控进化终极测试明日将开测 开放资格预下载已开启

由腾讯光子工作室群研发的开放世界生存进化手游《失控进化》宣布,终极测试将于明日正式开启,目前测试资格预下

2026-02-02