《拳皇97》作为经典格斗游戏，衍生出大量魔改版本，在原有基础上加入夸张特效、新角色和颠覆性机制。热门改版如《拳皇97风云再起》解锁全角色必杀技，《拳皇97屠蛇》加入超必杀瞬移和BOSS形态；《拳皇97HACK》则强化角色性能，甚至修改判定框。部分版本融入《街霸》《月华剑士》角色，或加入无限气、隐藏连招等设定。这些改版通过民间ROM传播，虽平衡性遭诟病，但凭借华丽视觉与突破原版的自由度，成为玩家怀旧与娱乐的另类选择。